Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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VPS72Q15906 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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VPS72Q15906 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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VPS72Q15906 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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VPS72Q15906 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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