Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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