Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1CQ13936 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms