Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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