Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CHD3Q12873 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CHD3Q12873 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CHD3Q12873 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CHD3Q12873 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHD3Q12873 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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