Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TPRNQ4KMQ1 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms