Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms