Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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SIX1Q15475 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SIX1Q15475 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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