Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
SMCO1Q147U7 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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