Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CACNA1SQ13698 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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