Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ACTBP60709 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ACTBP60709 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ACTBP60709 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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