Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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