Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CNTN3Q9P232 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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