Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms