Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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