Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RUNX3Q13761 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RUNX3Q13761 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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RUNX3Q13761 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RUNX3Q13761 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RUNX3Q13761 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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