Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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