Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECHS1P30084 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms