Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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