Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL24A1Q17RW2 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms