Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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ECM1Q16610 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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ECM1Q16610 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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ECM1Q16610 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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