Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ITGA9Q13797 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms