Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms