Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
EFEMP1Q12805 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.4 ms