Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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