Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm5538W4VSP6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm5538W4VSP6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm5538W4VSP6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm5538W4VSP6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5538W4VSP6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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