Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms