Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms