Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf1Q9Z1B8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms