Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms