Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms