Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs3Q9R1Z8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms