Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra1Q9R118 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms