Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed2Q9R0Q3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed2Q9R0Q3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed2Q9R0Q3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed2Q9R0Q3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms