Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms