Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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