Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms