Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lsm4Q9QXA5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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