Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms