Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms