Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms