Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms