Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SacsQ9JLC8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SacsQ9JLC8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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