Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms