Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AatfQ9JKX4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms