Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nova1Q9JKN6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms