Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms