Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tmod2Q9JKK7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod2Q9JKK7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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