Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms