Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms